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NEWS小鼠甲基化年龄预测 - 尊龙凯时生物医疗创新
来源:太叔家群 日期:2025-07-19【服务介绍】DNA甲基化是衰老过程中的重要表观遗传标志之一。随着个体衰老的加剧,一些特定的甲基化位点(CpG)在年龄增长过程中表现出动态变化。利用这些随年龄变化的CpG位点,并结合机器学习技术,构建的数学模型被称为表观遗传时钟。该时钟能够有效量化生物体的衰老速度,评估长寿与抗衰老干预措施的效果。
在这一领域,尊龙凯时团队对100只小鼠的血液基因组DNA进行了初步检测,分析了数百个与衰老相关的甲基化位点。我们建立了一个包含多种生物样本及其随月龄变化的甲基化频率数据库。通过机器学习筛选出那些与小鼠月龄显著相关的甲基化位点,进而构建了甲基化年龄预测模型。
利用此模型,团队成功预测了经历生殖压力的雌性小鼠的甲基化年龄,验证了方案的实施可行性。
技术服务
物种样本类型:
CpG位点:
小鼠血液:雌性/4个,雄性/3个
目标区间甲基化重测序(Hi-Methylseq),结合亚硫酸盐转化与靶向扩增子高通量测序技术,实现多区段、多位点的甲基化精确定量分析。
【检测结果展示】
• 选定的甲基化位点与小鼠月龄变化的显著性
• 预测生殖压力雌性小鼠的甲基化年龄
- CpG1
- CpG2
- CpG3
- CpG4
根据预测模型计算出的甲基化年龄(月份)和加速效应(月份):
- 衰老加速组的甲基化水平(实际年龄18月龄):440596727305
- 自然衰老组的甲基化水平(实际年龄18月龄):373525823669172221681824
注:甲基化预测模型为多元一次方程式。在检验小鼠样本的甲基化年龄时,仅需将选定甲基化位点的甲基化水平代入该模型,即可得到生物样本的甲基化年龄。通过该模型,预测自然衰老组小鼠(实际年龄18月龄)的甲基化年龄为1824月龄,而经历多次生殖压力的雌性小鼠(实际年龄18月龄)的甲基化年龄为222月龄,衰老加速效应达到396个月。
参考文献:
[1] Rivero-Segura NA, Bello-Chavolla OY, Barrera-Vázquez OS, et al. Promising biomarkers of human aging: In search of a multi-omics panel to understand the aging process from a multidimensional perspective. Ageing Research Reviews, 2020, 64: 101164.
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[3] Stubbs TM, Bonder MJ, Stark AK, et al. Multi-tissue DNA methylation age predictor in mouse. Genome Biology, 2017, 18: 1-14.
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